Podczas tworzenia zespołu użytkownik wstawia komponenty, tworzy elementy, układa komponenty w szyk, tworzy szkice itd. Natura procesu projektowania może utrudnić uporządkowanie operacji w taki sposób, aby przeglądarka modelu przestawiała zamierzony wynik. Trudności może również sprawiać zrozumienie roli każdego węzła przeglądarki w zespole, zwłaszcza jeśli użytkownik nie zmienił domyślnych nazw węzłów. Należy brać pod uwagę te problemy w miarę zwiększania wielkości i złożoności modeli zespołów. Inni użytkownicy mogą mieć trudności ze zrozumieniem, jak zbudowany jest dany model, a nawet sam twórca może mieć problemy z interpretacją różnych aspektów modelu.
Foldery przeglądarki zdefiniowane przez użytkownika stanowią narzędzia organizacyjne, które pozwalają grupować węzły w przeglądarce zespołu. Foldery przeglądarki tworzy się w oparciu o wybraną metodologię i grupuje się w nich odpowiednie węzły przeglądarki. Na przykład można tworzyć foldery według działu produkcji, dostawców, materiałów, typu elementów itp. Foldery służą do porządkowania przeglądarki zespołu w sposób umożliwiający lepsze przedstawienie celu projektu i usprawniający proces roboczy.
Foldery definiowane przez użytkownika są oznaczane różnorodnymi ikonami ( Otwarty folder: : Zamknięty folder:
). Można je także otwierać i zamykać, tak jak inne foldery przeglądarki programu Inventor.