È possibile visualizzare e nascondere i collegamenti nella vista scena come pure ogni categoria di collegamenti. In Autodesk Navisworks le impostazioni di visibilità specificate vengono mantenute alla chiusura di una sessione.
Quando i collegamenti sono visualizzati, è possibile ridurre l'ingombro dello schermo limitando il numero di collegamenti visibili nella vista scena, nascondendo le icone di collisione e utilizzando la funzione di esclusione. Inoltre, poiché ad alcune categorie di collegamenti standard possono essere associati dei commenti, è possibile scegliere di visualizzare soltanto i collegamenti con commenti.