En Autodesk Navisworks se incorporan los conceptos de conjunto de selección activa (los elementos seleccionados en ese momento o la selección actual) y de conjuntos de selección guardados. No puede guardar ningún conjunto de selección ni de búsqueda, pero puede utilizar los conjuntos de selección y de búsqueda guardados en el modelo (en la ficha Conjuntos del Árbol de selección).
Al seleccionar elementos, éstos se incorporan a la selección actual, de modo que puede ocultarlos o modificar los colores de los mismos.
Puede utilizar varios métodos para seleccionar elementos de forma interactiva e incorporarlos a la selección actual. Puede utilizar la lista desplegable del Árbol de selección, seleccionar los elementos directamente en la vista de escena mediante las herramientas Seleccionar y Cuadro de selección y también puede seleccionar otros elementos con propiedades similares a las de otra selección existente utilizando los comandos de selección.