在 HPC Linux 集群上设置和运行的步骤

下面介绍用户可以遵循的示例工作流：创建方案，然后借助便携式批处理系统 (PBS) 管理在 HPC Linux 集群上运行它们，最后在 Windows 上查看结果。

警告： 借助 SJM 在给定节点上每次只能运行一个事件，因为它通过特定的 TCP 端口运行，从而在不同进程之间和整个节点中进行通信。要启动需要运行 SJM 的方案，要求整个节点应阻止多个用户在同一节点上运行其方案。

1. 使用适用于分析的所有设置在 Synergy (Windows) 中创建和保存方案文件 (.sdy)。
2. 修改样板脚本文件（例如 example.pbs）以指定所需的资源和要运行的方案文件。
3. 通过 sftp 或者系统管理员提供的其他机制，将 .sdy 文件和 .pbs 文件传输到 Linux 计算机（主要执行节点）上的文件夹。通常使用 WinScp 之类的程序。
4. 使用 qsub mystudy.pbs 之类的单个作业，通过终端将作业提交到系统
5. 在作业已完成操作并且结果已传输回 Windows 客户端计算机时，将结果输入 Synergy 中。