HPC Linux 클러스터에서 설정 및 실행하려면

다음은 스터디를 작성한 후 PSB(Portable Batch System) 관리를 사용하여 HPC Linux 클러스터에서 실행하고, 최종적으로 Windows에서 결과를 검토하기 위해 따를 수 있는 워크플로우 예입니다.

경고: SJM의 경우 공정 간, 절점 간 통신을 위해 특정 TCP 포트를 통해 실행되므로 지정된 절점에서 한 번에 한 인시던스만 실행될 수 있습니다. SJM이 실행되어야 하는 스터디를 시작하려면 여러 사용자가 동일한 절점에서 스터디를 실행하지 못하도록 전체 절점에 요청하십시오.

1. Synergy(Windows)에서 해석에 대한 적절한 설정을 모두 사용하여 스터디 파일(.sdy)을 작성한 후 저장합니다.
2. 템플릿 스크립트 파일(예: example.pbs)을 수정하여 필요한 리소스 및 실행할 스터디 파일을 지정합니다.
3. sftp 또는 시스템 관리자가 제공하는 기타 메커니즘을 통해 Linux 시스템의 폴더(1차 실행 절점)에 .sdy 파일 및 .pbs 파일을 전송합니다. 이를 위해 WinScp와 같은 프로그램이 종종 사용됩니다.
4. 단일 명령(예: qsub mystudy.pbs)을 사용하여 터미널을 통해 작업을 시스템에 제출합니다.
5. 작업이 완료되고 결과가 Windows 클라이언트 시스템에 다시 전송되면 결과를 Synergy에 가져옵니다.