Można kontrolować rozmiar, lokalizację i wygląd katalogu struktury. Wiele z tych opcji można ustawić, klikając prawym przyciskiem myszy i wybierając opcję z menu kontekstowego.
- Rozmiar katalogu struktury można zmienić, przeciągając krawędź okna lub pasek tytułu (zazwyczaj znajduje się po lewej stronie, ale w pewnych okolicznościach może znajdować się z prawej strony okna).
- Panele można rozwijać i zwijać, klikając ikony
i 
. - Aby zadokować katalog struktury, należy przeciągnąć go na prawy lub lewy region dokowania okna aplikacji, tak aby został zablokowany w pozycji dokowania. Okno katalogu struktury można też zadokować, klikając dwukrotnie jego pasek tytułu.
- Aby oddokować katalog struktury, należy przeciągnąć obszar znajdujący się powyżej trzech kart z dala od regionu dokowania. Naciśnięcie klawisza CTRL podczas przeciągania zapobiega dokowaniu.
- Aby zakotwiczyć katalog struktury, należy użyć opcji Zakotwiczenie w prawo lub Zakotwiczenie w lewo z menu skrótów. Zakotwiczone okno katalogu struktury jest otwierane i zamykane, gdy jest nad nim przesuwany kursor myszy. Gdy zakotwiczone okno katalogu struktury jest otwarte, jego zawartość nakłada się na obszar rysunku. Nie można go tak ustawić, aby pozostawało otwarte.
- Gdy katalog struktury jest ruchomy, należy użyć funkcji autoukrywania, aby ustawić je do otwierania i zamykania wtedy, gdy będzie nad nim przesuwany kursor.