Większość ustawień konfiguracyjnych znajduje się w pliku szablonu (.dwt). Pliki szablonu wymagają dodatkowych plików pomocniczych w celu zaimplementowania ustawień konfiguracji w czasie rysowania.
W oknie dialogowym Opcje i w innych oknach dialogowych określających konfigurację ikona 
wskazuje ustawienia przechowywane w szablonach.
Pliki pomocnicze uzupełniają ustawienia w plikach szablonów; są to np. pliki rysunków zawierające niestandardowe listy części, tabelki rysunkowe itp. Począwszy od programu AutoCAD Mechanical 2009, domyślne położenie niektórych z tych plików zostało zmienione w następujący sposób:
- Uprawnienia użytkownika o ograniczonych uprawnieniach na stacji roboczej. Program AutoCAD Mechanical toolset można uruchomić, używając konta użytkownika o ograniczonych uprawnieniach. Oznacza to, że w celu uruchomienia programu AutoCAD Mechanical toolset nie trzeba już mieć uprawnień administratora ani użytkownika zaawansowanego.
- Przekazywanie profilów. Funkcja przekazywania profilów umożliwia logowanie się na dowolnym komputerze w sieci przy zachowaniu swoich ustawień użytkownika. Niektóre pliki, takie jak ustawienia i dokumenty osobiste, są przenoszone między komputerami używanymi przez użytkownika, a inne pliki, takie jak szablony, są przechowywane tylko w jednym systemie.
Poniższe łącza kierują do szczegółów dotyczących położeń plików.