與專案關聯的任何檔案 (圖面或其他)，尤其是將從版本控制中獲益的任何檔案，均應儲存在專案中。臨時檔案 (例如初始設計圖面) 不需要儲存在專案中。
為便於使用，所有專案應使用一致的資料夾結構和資料夾名稱。如果使用專案樣板，則會取得一種實用的結構。如果預設版本不適合，您可以輕鬆建立自己的自訂樣板。
無需為點資料庫檔案或測量資料庫建立資料夾。這些資料將自動直接儲存在主專案資料夾之下。
專案還可以包括不是圖面的檔案。可以使用 Vault 直接在專案資料夾下為這些檔案建立資料夾。可能的資料夾名稱包括：提案、客戶方的等同詞和合同。可以使用 Vault 工具來儲存和存取非圖面資料夾中的檔案。
使用物件時，您可以將關聯的圖面出庫使用 Vault 並從工作資料夾中使用這些圖面。工作資料夾中的物件將從 Vault 檔案倉庫中進行物理複製。其他使用者仍可取得這些檔案的唯讀複本，但在您重新入庫納管這些檔案之前，他們無法對其進行編輯。透過這種方法，您可以保留每個圖面的單一主版本。
當您將檔案重新入庫納管到 Vault 中時，工作資料夾中的修訂版將複製到伺服器上的檔案倉庫中。Vault 資料庫將使用相應的修訂資料標示檔案並使其可用於使用者。
您可以變更工作資料夾，而不用擔心 Vault 資料庫中的資料會遺失，但通常僅在需要處理不同 Vault 資料庫中的專案時，才會變更工作資料夾。為避免混淆，請為每個 Vault 資料庫使用單獨的工作資料夾。
預設的工作資料夾位置為 C:\Users\Public\Documents\Autodesk\Civil 3D Projects。
專案可以工作資料夾下架構中任何層級建立。例如，在工作資料夾中，您可以有一個以年份命名的資料夾，然後可以將與該年份關聯的專案儲存在此資料夾中。
Autodesk Vault 允許專案和資料夾在任何情況下為巢狀，具有您希望的多個層級。當處理 Autodesk Civil 3D 時，專案會總是加入至工作資料夾。在工作資料夾內，專案可以建立在工作資料夾下架構中的任何層級 (專案可以直接建立在工作資料夾中，或在工作資料夾中的子資料夾內)。 「探勘器」樹狀目錄可以在物件類型資料夾內顯示〈子資料夾中存在的專案物件〉。
為取得最佳結果，請避免在其他專案內建立專案。Autodesk Civil 3D 中的「探勘器」頁籤可能會以未預期的方式顯示在其他專案中為巢狀的專案。例如，空資料夾在「探勘器」中顯示的層級可能不同於架構中空資料夾相同層級的資料夾的層級，但後述資料夾包含專案。
若要取得有關使用工作資料夾的最佳實踐，請參閱〈工作資料夾規劃〉 《Autodesk Civil 3D最佳實踐 指南》。