Set di strumenti AutoCAD Architecture 2024 consente di creare un backup del file APJ che è possibile utilizzare per ripristinare tale file nel caso in cui quello originale risulti danneggiato o venga eliminato accidentalmente. Il file di backup si trova nella stessa cartella del file APJ originale ed è caratterizzato dall'estensione .ap$, ad esempio <nomeprogetto>.ap$. Per ripristinare il file APJ, modificare l'estensione di <nomefile>.ap$ in <nomeprogetto>.apj.
Quando il file APJ di un progetto viene eliminato o risulta danneggiato, il progetto non verrà più visualizzato nell'Archivio dei progetti. Il problema non ha alcun effetto sui file DWG e XML contenuti nel progetto, che rimangono comunque disponibili.