Funkcja sprawdzania przenikania umożliwia szybkie zidentyfikowanie części sieci rurociągów, które kolidują ze sobą nawzajem.
Sprawdzenie odbywa się poprzez porównywanie modeli trójwymiarowych części. Operację sprawdzenia przenikania można przeprowadzić w celu zidentyfikowania części sieci zachodzących na siebie, kolidujących ze sobą lub przecinających się w niewłaściwy sposób, lub też takich, które naruszają wstępnie zdefiniowane kryteria bliskości.
Sprawdzenie umożliwia na przykład wykrycie fizycznego zachodzenia na siebie jednej lub wielu sieci rurociągów albo sytuacji, w których odległość między nimi jest za mała. Użytkownik może wybrać oparte na stylu znaczniki wizualne wskazujące przenikanie lub nakazać wyświetlenie przenikań w postaci rzeczywistych modeli trójwymiarowych. Przenikania można pozostawić bez zmian lub wyeliminować je, przemieszczając części na rysunku.
Do sprawdzenia przenikania można wybrać jedną sieć rurociągów lub dwie sieci. Kontrola przenikania w ramach jednej sieci obejmuje tylko części należące do tej sieci. Sprawdzenie dwóch sieci pozwala na wykrycie przenikania dwóch różnych sieci rurociągów.
Na poniższej ilustracji przedstawiono dwie różne sieci rurociągów zawierające struktury fizycznie nakładające się. Sprawdzenie przenikania pozwoliłoby na szybkie wykrycie przenikania się tych części.
Mechanizm sprawdzania wykrywa też inny rodzaj przenikania, w którym dwie rury krzyżują się, ale nie są połączone żadną strukturą, tak jak na następujących ilustracjach:
W razie potrzeby można także sprawdzić, czy części sieci rurociągów, przedstawione jako modele trójwymiarowe, nie są umieszczone zbyt blisko siebie i nie naruszają tym samym wstępnie zdefiniowanego kryterium odległości lub współczynnika skali. Najbliżej położone punkty dwóch sieci rurociągów przedstawione na poniższej ilustracji dzieli odległość mniejsza niż dziesięć stóp, ale sieci te fizycznie nie kolidują ze sobą.
Funkcja sprawdzania przenikania umożliwia wskazanie w reprezentacji trójwymiarowej tych części, których odległość od innych części sieci jest mniejsza od zadanej. Odległość każdej części od części w jej otoczeniu sprawdzana jest we wszystkich kierunkach.
Sprawdzenie przenikania powoduje utworzenie obiektu Sprawdzenie przenikania i wyświetlenie go w oknie Nawigator, w grupie Sieci rurociągów 
Sprawdzenia przenikania.
Kryteria sprawdzania bliskości 3D
Po włączeniu opcji sprawdzania bliskości 3D w ramach sprawdzania przenikania użytkownik może uzyskać na modelu 3D informacje o częściach sieci rurociągów znajdujących się zbyt blisko siebie, z uwzględnieniem określonego kryterium odległości lub współczynnika skali.
Sprawdzanie bliskości w ramach jednej sieci powoduje utworzenie przenikań części, których wzajemne odległość jest mniejsza od określonej. Sprawdzanie bliskości w ramach dwóch sieci powoduje utworzenie przenikań między częściami jednej sieci, których odległość lub współczynnik skali względem jakichkolwiek części drugiej sieci są mniejsze od określonych.
Funkcja sprawdzania bliskości 3D umożliwia potwierdzenie zgodności projektu sieci komunalnych z wymogami dotyczącymi minimalnych odległości. Na przykład rura wodociągowa krzyżująca się z rurą kanalizacyjną musi znajdować się co najmniej 46 cm nad tą drugą. Sprawdzenie przenikania z parametrem Użyj odległości ustawionym na 46 cm spowoduje zidentyfikowanie części odległych o mniej niż 46 cm od drugiej sieci.
Na poniższej ilustracji przedstawiono sposób wykorzystania zadanej wartości odległości i współczynnika skali do określania naruszeń warunków bliskości 3D. Ciemniejsze, cieniowane, obrysowane elementy przedstawiają rzeczywiste części wybranej sieci rurociągów. Jaśniejsze przedstawiają powierzchnię wykorzystywaną do identyfikacji przenikania.
Określanie odległości
Po wprowadzeniu odległości określonej do przeprowadzenia kontroli odległości spowoduje utworzenie przenikań dla części sieci rurociągów odległych od innych części określonych sieci o mniej niż zadana odległość w dowolnym kierunku.
Określanie współczynnika skali
Jeśli wybrana została opcja Użyj współczynnika skali, można wprowadzić wartość używaną jako współczynnik skali. Po wprowadzeniu wartości współczynnika skali program Autodesk Civil 3D opcja ta umożliwia obliczanie granic części (rury lub struktury) pomnożonych przez wybraną wartość współczynnika skali. Na przykład jeśli średnica rury wynosi 600 mm i określono wartość współczynnika skali jako 2, program Autodesk Civil 3D zidentyfikuje wszystkie przenikania w odległości 1200 mm (albo średnicy rury, która wynosi 600, pomnożonej przez wartość współczynnika skali równej 2). W trakcie sprawdzania przenikania części sieci rurociągów wszelkie części znajdujące się zbyt blisko innych części (odległość sprawdzana jest we wszystkich kierunkach) zostaną oznaczone jako przenikania.