При создании двери или окна, идущих до основания стены, выполняется разрыв фундаментной стены под новым элементом.
Для изменения стандартного поведения обратитесь к свойствам типоразмера фундаментной стены и снимите флажок "Не разрывать в местах вставки". См. раздел Свойства типоразмера фундаментных стен.