После обработки всех конфликтов для детали желтый предупреждающий значок меняется на зеленую точку.
Можно нажать CTRL+A, чтобы выбрать все типоразмеры компонентов в списке "Конфликты размеров", и выбрать "Пометить как разрешенный", чтобы отметить все конфликты как разрешенные.
Панель: Редактирование деталей