Polecenia programu Zestaw narzędzi AutoCAD Mechanical tworzą warstwy programu Mechanical w locie i zazwyczaj nie ma potrzeby tworzyć warstw ręcznie. Jeżeli jednak jest to konieczne, warstwy mechaniczne można tworzyć przy użyciu polecenia AMLAYER. Polecenie AMLAYER wyświetla Menedżera warstw programu Mechanical, który umożliwia utworzenie warstwy mechanicznej na podstawie istniejącej definicji warstwy lub utworzenie nowej warstwy mechanicznej (i definicji).
Tak samo jak w przypadku Menedżera warstw (polecenie LAYER programu AutoCAD) Menedżer warstw programu Mechanical umożliwia ustawianie właściwości warstw. Można również ustawić właściwości definicji warstw, co jest niemożliwe w przypadku polecenia LAYER.
Po użyciu polecenia LAYER do zmiany właściwości warstwy mechanicznej właściwości warstwy nie pasują już do swoich definicji. Jeżeli jest to konieczne, można zresetować wszystkie warstwy mechaniczne, aby dopasować właściwości ich definicji za pomocą polecenia AMLAYRESET.