Приложение Autodesk Navisworks позволяет манипулировать преобразованиями объектов (переносом, поворотом и масштабированием), а также изменять представление (цвет и прозрачность) объектов. Все манипуляции объектами выполняются в панели "Сцена".
Все изменения атрибутов объектов считаются глобальными (как если бы они были выполнены в исходной модели САПР) и могут быть сохранены вместе с файлами Autodesk Navisworks. Имеется возможность восстановить исходное состояние атрибутов объектов, т. е. то состояние, с которым они были импортированы из исходных файлов САПР.
Можно временно изменить положение, угол поворота, размер и внешний вид объектов геометрии в целях анимации. Эти изменения не являются глобальными; они могут быть сохранены (или "записаны") только как ключевые кадры анимации.
В Autodesk Navisworks Freedom имеется возможность восстановить атрибуты объектов в то состояние, в котором они находились при импорте из исходных файлов САПР. Это приводит к удалению всех переопределений цветов, прозрачности и преобразований, которые могли быть применены в Autodesk Navisworks Manage или Autodesk Navisworks Simulate.