目录结构包括三个选项卡：“当前”选项卡、“外部工程图”选项卡和“收藏夹”选项卡。
“当前”选项卡显示了当前工程图中结构零部件和文件夹的定义。如果工程图包括外部参照零部件和文件夹，则源文件的详细信息将显示在“文件参照”面板上。
“外部工程图”选项卡显示了导航图标的层次结构，用户可以使用这些图标从计算机、网络驱动器和 Autodesk Vault 访问外部文件。可以使用“添加到收藏夹”快捷菜单选项为包含常用文件的文件夹设置书签。之后，可以通过“收藏夹”选项卡快速访问这些文件。
典型的文件管理和组织操作包括：
此操作包括将文件夹添加到“收藏夹”选项卡，以及从此选项卡中删除废弃的文件夹。
将参照的文件保存到其他位置或保存为其他名称时，主工程图中的所有外部参照 (xref) 零部件都将参照新位置/名称。
将参照的文件从一个位置移动到另一位置时通常使用此选项，且主工程图中的外部参照零部件必须重定向到新位置。
如果打开主工程图时在源中更改了参照的文件，则一个提示窗口将通知用户此文件需要重新加载。可以重新加载此文件，以便将最新的修改引入主工程图。
尽管可以卸载参照的文件，但与 AutoCAD 不同，执行卸载操作并没有什么好处。