大文字と小文字を区別する照合はグローバル設定ではありません。この設定は各ポイント グループ別に適用されます。
[ポイント グループ プロパティ]ダイアログ ボックスの[クエリー ビルダー]タブにある[照合で大文字と小文字を区別]チェック ボックスは[ポイント グループ プロパティ]ダイアログ ボックスの[未処理注釈で照合]タブ、[ポイントの選択]タブ、および[除外]タブで注釈照合が実行される方法を指定します。