Это предупреждение может отобразиться при копировании элемента из главной модели в вариант конструкции.
Проблема. В этом случае элемент существует в главной модели и в варианте конструкции. В результате 2 таких элемента накладываются друг на друга.
Решение: для устранения причины удалите элемент из главной модели или из варианта конструкции.
При попытке перенести элемент из главной модели в вариант конструкции, вырежьте элемент из модели (вместо копирования элемента) или воспользуйтесь инструментом "Добавить в набор".